Việc thường xuyên bảo trì hoặc định kỳ hút hầm cầu Bình Thạnh là cần thiết để giảm tình trạng ô nhiễm từ nguồn nước thải và ngăn ngừa tình trạng tắc nghẽn đường ống nước ngầm. Việc hút hầm vệ sinh định kỳ cũng giúp ngăn ngừa tình trạng tắc nghẽn và mùi hôi từ hầm cầu do bể chứa bị đầy.
Các dấu hiệu như bồn cầu chảy chậm, xả nước có mùi hôi, và hệ thống thoát nước kêu cót két là những dấu hiệu cần hút hầm cầu. Thời gian hút hầm cầu phụ thuộc vào số lượng người sử dụng bể, thành phần nước thải, nhiệt độ môi trường và kích thước hầm cầu.
Chu kỳ hút hầm cầu tại nhà thường diễn ra 2-3 năm một lần hoặc khi hầm cầu đầy. Ngoài ra, để duy trì một lượng vi sinh vật kỵ khí trong bể, khi hút bùn bể tự hoại phải để lại một phần bùn cũ (10-20%). Đối với khu vực trũng thấp, cần tránh xả hút bùn bể phốt vào thời điểm mực nước ngầm cao hơn đáy bể để tránh áp lực nổi gây vỡ, nứt bể phốt và các công trình lân cận.
